安徽工程勘察院成立于1986年,由安徽省地質(zhì)礦產(chǎn)局第二水文隊(duì)三分隊(duì)組建成立,早期名稱為安徽地質(zhì)工程公司,主營工程地質(zhì)勘察、水文地質(zhì)勘察、水井施工。
1990年機(jī)構(gòu)調(diào)整,整體劃為安徽省地礦局直屬事業(yè)單位(正處級),并經(jīng)原地礦部批準(zhǔn)更名為地礦部安徽工程勘察院,取得建設(shè)部工程勘察甲級資質(zhì)。
1997年,因戰(zhàn)略性結(jié)構(gòu)調(diào)整,地礦部安徽工程勘察院與327地質(zhì)隊(duì)等五個(gè)處級單位合并組建新的327地質(zhì)隊(duì),同時(shí)保留安徽工程勘察院番號。
2002年,取得住建部工程勘察綜合類甲級資質(zhì)。
2021年9月公司更名為安徽工程勘察院有限公司。